Чарыш начинается на отрогах Коргонского и Теректинского хребтов (Западный Алтай). Основные притоки -- Кумир и Коргон.
Практически на всем протяжении Чарыш представляет собой достаточно спокойную реку, текущую по широкой долине. Препятствий выше 2 к.с. на реке нет. Отсутствуют так же сколь-нибудь опасные участки.